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classe wandb.Molecule

Classe W&B pour les données moléculaires 3D.

Arguments

  • data_or_path : Molecule peut être initialisé à partir d’un nom de fichier ou d’un objet IO.
  • caption : Légende de la molécule pour l’affichage.
  • kwargs :

Méthodes

méthode Molecule.from_rdkit()

Convertissez les types de fichiers et d’objets pris en charge par RDKit en wandb.Molecule.
Arguments
  • data_or_path: (chaîne, rdkit.Chem.rdchem.Mol) La Molecule peut être initialisée à partir d’un nom de fichier ou d’un objet rdkit.Chem.rdchem.Mol.
  • caption: (chaîne) Légende associée à la Molecule pour l’affichage.
  • convert_to_3d_and_optimize: (bool) Convertit en rdkit.Chem.rdchem.Mol avec des coordonnées 3D. Il s’agit d’une opération coûteuse qui peut prendre beaucoup de temps pour les Molecules complexes.

méthode Molecule.from_smiles()

Convertit une chaîne SMILES en wandb.Molecule.
Arguments
  • data: Chaîne SMILES.
  • caption: Légende associée à la molécule pour l’affichage.
  • sanitize: Vérifie si la molécule est chimiquement valide selon la définition de RDKit.
  • convert_to_3d_and_optimize: Convertit en rdkit.Chem.rdchem.Mol avec des coordonnées 3D. Il s’agit d’une opération gourmande en calcul, qui peut prendre beaucoup de temps pour les molécules complexes.